我们看到了什么

Paper2Agent 的 README 提供把科研代码库转成 MCP 工具的方法，并列出 TISSUE、Scanpy 等任务示例。这里只核查公开方法，未安装、运行或验证科研结果。

还没核实的

• 照着做能不能出一样的效果：没复现，不保证。
• 成本和耗时：没测，这里不填。
• 原帖细节：以原始出处为准。

想自己试

1. 从 README 了解将论文与代码库交给编程代理的入口。
2. 按示例明确需要转换的任务或教程，再生成工具接口。
3. 本条未执行仓库或核验科研结果；README 要求支持技能和并行子代理的编程代理环境，以及目标仓库自己的 Python、R、GPU 或 API 条件，密钥通过环境变量提供。

步骤按方法出处整理，以原作者的说明为准。

准备条件

需要支持技能与子代理的开发环境，以及目标仓库自己的Python、R、GPU或API条件。

• 检查工具接口能否跑通与输出来源，科研结论另行验证，密钥不进生成物。

使用边界

依据已保存的来源材料作编辑整理；未重新实测原作，使用前请核对原始出处及当前工具条件。

• 本次核对README的任务入口、环境前提和项目方示例；未安装、运行或验证科研结论，不称本周新项目。
• README 的科研示例（如因果基因分析，L160-165、L182-186）是项目方演示，本站未运行，也未验证科研结论。
• 可能需要 GPU、R 或第三方 API，费用未知。
• README 引用 2026 年 Nature 论文，论文结论不等于本站核实。